认罪认罚不起诉的情况下，根据相关法律规定，犯罪嫌疑人或被告人自愿如实供述自己的罪行，并承认指控的犯罪事实，愿意接受处罚的，可以依法从宽处理。然而，即便是在认罪认罚不起诉的情况下，只要构成犯罪，就会留有案底。案底是指犯罪记录，它会伴随个人终身，并对个人的社会活动产生影响。
需要注意的是，案底的具体处理可能因案件性质、犯罪情节等因素而有所不同。在某些情况下，如犯罪情节轻微，依照刑法规定不需要判处刑罚或者免除刑罚的，人民检察院可以作出不起诉决定。
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